一般情况下，两个档案合并后办理退休。
当然，对职工出生时间的认定，采取身份证和档案相结合的办法，身份证和档案不一致的，以档案中最先记载的出生时间为准。按照正常的程序办理即可。
年龄的认定国家早就出台过明确规定：对职工出生时间的认定，采取身份证和档案相结合的办法，身份证和档案不一致的，以档案中最先记载的出生时间为准。对于出生时间的认定，档案的证明力是更高的，如果你按照身份证已经达到了退休年龄，但档案上记载的还没达到，那么就无法办理退休手续。为什么要这样规定呢?这是为了防止随意更改职工出生时间和编造档案。有人想通过修改出生时间来提前退休，这样就能提前领取养老金，这对其他参保人员是不公平的，所以要以档案中最先记载的出生时间为准。
有两个档案退休以哪个为准
一个人不可能有两个档案 ，如果存在着两份档案，那有一份肯定是假档案 ，假档案是不能算数的 。
